Aug 302012
 

2015-06-16 更新:
这里讲的方法可能已经不管用了,至少在我使用Solaris 10 的VirtualBox Image的时候,下面的方法行不通。

Install Solaris 10 and install R under Solaris
最近的写的一个R package vcf2geno不能在Solaris 10 下编译。
为了解决这个问题,我决定重复CRAN上Solaris 10的测试环境
下面写个流水账

1.安装Virtual Box
下载,安装。

2.安装Solaris 10 和 Guest OS
一定要注意的是手动分区,把/tmp的容量设置到5G以上。不然默认的/tmp只有512M,这样就不方便安装Solaris Studio (第3步)。
安装virtualBox的Guest OS 软件后,Solaris的屏幕分辨率增加。

3.安装Solaris Studio 12.3
下载,解压,安装 (就是特别慢)

4.安装OpenSolaris
Solaris里面没有ubuntu的apt和fedora的yum,但是有个类似的软件叫做OpenCSW Link.
参考OpenCSW的手册Getting Start.
然后用pkgutil安装tetex, gcc4g++, iconv, readline

5.下载R
去R的主页下载源代码,然后解压

6.配置环境参数,安装

export CC=suncc
export CFLAGS="-xO5 -xc99 -xlibmil -nofstore"
export CPICFLAGS=-Kpic
export F77=sunf95
export FFLAGS="-O5 -libmil -nofstore"
export FPICFLAGS=-Kpic
export CXX="sunCC -library=stlport4"
export CXXFLAGS="-xO5 -xlibmil -nofstore -features=tmplrefstatic"
export CXXPICFLAGS=-Kpic
export FC=sunf95
export FCFLAGS=$FFLAGS
export FCPICFLAGS=-Kpic
export LDFLAGS=-L/opt/sunstudio12.1/rtlibs/amd64
export SHLIB_LDFLAGS=-shared
export SHLIB_CXXLDFLAGS=-G
export SHLIB_FCLDFLAGS=-G
export SAFE_FFLAGS="-O5 -libmil"

export CPPFLAGS=’-I/opt/csw/include -I/opt/csw/include/readline’
export LDFLAGS=’-L/opt/sunstudio12.1/rtlibs/amd64 -L/opt/csw/lib’

export PATH=/usr/xpg4/bin:$PATH
export PATH=/usr/sfw/bin/:$PATH

之后我们依次执行:
./configure
gmake #(Solaris下面的GNU make)
gmake install

经验:

    Solaris下自带的软件很少,常用软件要到OpenCSW下载
    Solaris的路径设置和Linux很不同,不在/usr/bin, /usr/local/bin等等。这时候可以用glocate来快速查找, 见【2】

主要参考:
【1】http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-admin.html#Solaris
【2】Solaris下的locate工具. Link
【3】http://www.opencsw.org/get-it/packages/

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